El SIIFA, Sistema de Información Integral Financiero y Asistencial, es la plataforma del Ministerio de Salud y Protección Social donde se registran los contratos, las facturas, las radicaciones y los pagos del Sistema General de Seguridad Social en Salud.
Su propósito es hacer visible el flujo de recursos: saber qué se contrató, qué se facturó, qué se radicó y qué se pagó, sin depender de que cada actor lo informe a su manera.
En resumen
- Qué es: la plataforma nacional de trazabilidad financiera y asistencial del sistema de salud.
- De dónde viene: la Ley 1966 de 2019 la ordenó; el Decreto 228 de 2025 la reglamentó; la Resolución 1962 de 2025 definió su estructura y módulos.
- Cuántos módulos tiene: cuatro. Contratación, FEV y RIPS, seguimiento a facturas y seguimiento a pagos.
- Quiénes reportan: entidades responsables de pago y prestadores de servicios de salud, incluidos proveedores de tecnologías en salud y gestores farmacéuticos.
- Qué identificador introduce: el CUCON, el código único de contrato.
- Cómo se implementa: de forma gradual y progresiva, por grupos y por módulos, a lo largo de 2025 y 2026.
Las normas que lo sostienen
| Norma | Qué aportó |
|---|---|
| Ley 1966 de 2019 | Ordenó el sistema integral de información financiera y asistencial (art. 3) y el registro de la contratación de servicios y tecnologías en salud (art. 4) |
| Decreto 228 de 2025 | Reglamentó el SIIFA y definió a quién aplica |
| Resolución 1962 de 2025 | Estableció estructura, responsabilidades, manuales, comité técnico, periodicidad de reporte e implementación gradual |
A quién aplica
El alcance es amplio y va más allá de las IPS:
Entidades responsables de pago: EPS, entidades adaptadas, ARL, entidades territoriales, entidades que administran regímenes especiales y de excepción, el fondo de salud de la población privada de la libertad, aseguradoras SOAT, planes voluntarios de salud y la ADRES.
Prestadores y proveedores: IPS, profesionales independientes, transporte especial de pacientes, entidades con objeto social diferente, y proveedores de tecnologías en salud, incluidos operadores logísticos, gestores farmacéuticos, organizaciones no gubernamentales y universidades que realicen estas actividades.
Los cuatro módulos
1. Registro de contratación de servicios y tecnologías en salud. Los acuerdos de voluntades con su detalle de servicios, modificaciones y liquidación. Es el módulo que genera el CUCON.
2. FEV en salud y RIPS. Opera a través del Mecanismo Único de Validación. Es el punto donde el RIPS y la factura electrónica se cruzan y se emite el CUV.
3. Seguimiento a facturas. Radicación, devoluciones, glosas, objeciones y respuestas. Aquí queda registrado el número único de radicación que el pagador genera y reporta.
4. Seguimiento de pagos. Pagos de tesorería de las entidades pagadoras y giro directo realizado por la ADRES.
Vistos juntos, los cuatro módulos reconstruyen el ciclo completo del dinero: del contrato a la factura, de la factura a la radicación, de la radicación al pago.
CUCON: el código que ata la factura al contrato
El Código Único de Contrato es una cadena de 64 caracteres generada por el SIIFA mediante SHA-256, una vez la entidad responsable de pago registra el contrato y el contratista lo acepta.
Su función es eliminar la ambigüedad. Antes, el número de contrato viajaba en la factura como texto libre, con las variaciones de digitación que eso implica. Con el CUCON, cada factura queda atada al contrato exacto bajo el cual se prestó el servicio.
Desde la Resolución 948 de 2026, el CUCON es parte de la identificación del contrato en el XML de la factura electrónica en salud. Es decir: el SIIFA dejó de ser un sistema paralelo y pasó a ser parte del circuito de facturación.
Cómo se implementa
La Resolución 1962 de 2025 previó una implementación gradual y progresiva, con transitoriedad entre julio de 2025 y junio de 2026, organizada por grupos de actores y por módulos. Cada combinación pasa por una etapa de sensibilización y pruebas antes del inicio de operación.
El módulo de registro de contratación fue el primero en entrar, y el despliegue de los demás se escalonó a lo largo de 2026. El cronograma vigente por grupo se publica en los canales oficiales del Ministerio, y conviene verificarlo ahí antes de planear una fecha interna.
Qué implica para una IPS
El contrato deja de vivir solo en un PDF. Si el contrato no está registrado y aceptado en SIIFA, no hay CUCON. Y sin CUCON, la factura queda incompleta en la identificación del contrato.
La radicación se vuelve verificable. El pagador genera un número único de radicación y lo reporta. Deja de ser posible discutir si una factura fue radicada o no.
El ciclo de glosas queda registrado. Devoluciones, objeciones y respuestas viven en el módulo de seguimiento a facturas, con fechas.
Los tiempos quedan expuestos. Cuando contrato, radicación y pago están en la misma plataforma, la demora tiene nombre y fecha. Para un prestador con cartera vencida, eso es una herramienta.
Qué debe hacer tu software para integrarse
- Tomar el CUCON del contrato registrado en SIIFA e incorporarlo en la factura, en lugar de un campo de texto libre.
- Generar la factura y el RIPS en las versiones vigentes, para pasar el MUV y obtener el CUV.
- Registrar el número único de radicación que emite el pagador y conservarlo asociado a la factura.
- Gestionar devoluciones, glosas y respuestas con fechas y soportes, en coherencia con lo reportado en SIIFA.
- Conciliar pagos contra lo radicado, incluido el giro directo de la ADRES.
- Mantener la parametrización de contratos (tarifario, servicios contratados, vigencias) sincronizada con lo registrado en la plataforma.
El punto 6 es donde más se rompe la operación en la práctica. Cuando el tarifario del sistema no coincide con el contrato registrado, la diferencia aparece como glosa meses después.
Cómo lo resuelve Omneri
Omneri maneja el contrato como una entidad del sistema, no como un dato suelto en la factura: el tarifario, los servicios contratados y las vigencias viven en el mismo lugar del que se alimenta la facturación.
- CUCON incorporado en la identificación del contrato dentro del flujo de facturación.
- RIPS y factura generados desde la atención, validados antes de llegar al MUV.
- Radicación y su número único registrados y asociados a cada factura.
- Glosas y devoluciones con soporte clínico vinculado y trazabilidad de tiempos.
- Cartera conciliada contra lo radicado y lo efectivamente pagado.
Puedes ver el pilar de facturación y recaudo o solicitar una demo.
Preguntas frecuentes
¿SIIFA reemplaza al MUV?
No. El Mecanismo Único de Validación es el componente que valida el RIPS contra la factura y emite el CUV, y opera como parte del módulo de FEV en salud y RIPS del SIIFA. El SIIFA es el sistema completo; el MUV es una de sus piezas.
¿Una IPS debe registrar sus contratos en SIIFA?
El registro de la contratación lo realiza la entidad responsable de pago, y el contratista lo acepta. De esa aceptación nace el CUCON. Así que la IPS no queda al margen: sin su aceptación no hay código, y sin código la factura queda incompleta en la identificación del contrato.
¿Qué pasa si el contrato no tiene CUCON?
La factura pierde la identificación estandarizada del contrato bajo el cual se prestó el servicio. Como el CUCON hace parte del modelo de facturación electrónica en salud desde la Resolución 948 de 2026, conviene verificar que los contratos vigentes estén registrados y aceptados antes de facturar contra ellos.
¿Desde cuándo es obligatorio?
La Resolución 1962 de 2025 estableció una implementación gradual y progresiva por grupos y por módulos, con transitoriedad entre julio de 2025 y junio de 2026. La fecha que aplica a una institución concreta depende del grupo y del módulo, y el cronograma vigente se publica en los canales oficiales del Ministerio.
¿SIIFA cambia la forma de gestionar glosas?
No cambia el procedimiento de glosas, que sigue sus propias reglas y tiempos. Lo que cambia es la visibilidad: radicación, devoluciones, objeciones y respuestas quedan registradas en una plataforma común, con fechas verificables por ambas partes.